UABDivulga - Barcelona recerca i innovació

Als últims anys, la producció ramadera ha sofert grans canvis, el que ha afectat la presència de les malalties dels animals de granja, requerint mesures de control mes sofisticades. Al mateix temps, han aparegut nous mètodes de diagnòstic basats en la seqüenciació del material genetic dels virus. L'obtenció de seqüències de nucleòtids permet l'estudi de la evolució dels virus per mitjà de reconstrucccions filogenètiques. Aquestes reconstruccions es poden fer servir per deduir caracteristiques dels virus per la seva semblança amb soques ja conegudes i per realitzar estudis epidemiològics. És a dir, dues soques d'un mateix virus molt semblant a nivell genètic solen compartir característiques com la virulència vers l'hoste o la protecció creuada. A més a més, les reconstruccions filogenetiques permeten seguir l'evolució del virus i traçar l'origen d'un brot.

En calcular reconstruccions filogenètiques hi ha una sèrie de punts a tenir en compte. La selecció de les seqüències a utilitzar, el millor dels mètodes de reconstrucció filogenètica i com evaluar la solidesa de l'arbre filogenètic obtingut poden tenir grans repercusions alhora d'obtenir una analisi fiable. Recentment, hem realitzat una revisió d'aquests punts on també es donen una serie d'exemples d'aplicacions actuals i futures de les recontrucions filogenètiques en el control de malalties d'animals de granja.